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-- 发布时间:9/23/2004 2:05:00 AM
-- [合集]帮忙看看我这样的想法
[合集]帮忙看看我这样的想法 发信人: kingsyl (Healthy is first.), 信区: Bioinformatics 标 题: [合集]帮忙看看我这样的想法 发信站: 北大未名站 (2004年06月02日18:56:05 星期三), 站内信件 ─────────────────────────────────────── 作者 clastw (), 信区: Bioinformatics 标题 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日11:32:29 星期天) , 站内信件 ─────────────────────────────────────── 我是分子生物的研究生,每天实验枯燥不说,还接触很多毒性物质,想考博士去学习生物 信息这样,就可以不用做那些分子实验了,再说我对生物信息有些兴趣,怎样? ─────────────────────────────────────── 作者 lazy (draughts), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日11:34:44 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── 挺好的, 有实验方面的背景做计算挺好的 【 在 clastw () 的大作中提到: 】 : 我是分子生物的研究生,每天实验枯燥不说,还接触很多毒性物质,想考博士去学习生物 : 信息这样,就可以不用做那些分子实验了,再说我对生物信息有些兴趣,怎样? ─────────────────────────────────────── 作者 lylover (白愁飞(cinderella)), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日12:56:16 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── 显然是好事情,不过最好还是去做bioinfo的实验室。而且,如果不作实验,就坚决不要 作实验,要是以为一边作实验一边作计算是可能的,那... 【 在 clastw () 的大作中提到: 】 我是分子生物的研究生,每天实验枯燥不说,还接触很多毒性物质,想考博士去学习生物 信息这样,就可以不用做那些分子实验了,再说我对生物信息有些兴趣,怎样? ─────────────────────────────────────── 作者 clastw (), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日14:39:37 星期天) , 站内信件 ─────────────────────────────────────── 很诚恳的问,为什么? 【 在 lazy (draughts) 的大作中提到: 】 : 挺好的, 有实验方面的背景做计算挺好的 ─────────────────────────────────────── 作者 Feynman (KaKa), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日14:42:32 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── 学科交叉呀:) 【 在 clastw () 的大作中提到: 】 : 很诚恳的问,为什么? ─────────────────────────────────────── 作者 lynnet (小林), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日16:06:44 星期天) , 站内信件 ─────────────────────────────────────── 为什么不要既做试验又做算法分析,两者能结合不是很好么? 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : 学科交叉呀:) ─────────────────────────────────────── 作者 Feynman (KaKa), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日16:15:34 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── hehe,如果你是boss,这样当然很好啊 【 在 lynnet (小林) 的大作中提到: 】 : 为什么不要既做试验又做算法分析,两者能结合不是很好么? ─────────────────────────────────────── 作者 clastw (), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日16:32:27 星期天) , 站内信件 ─────────────────────────────────────── 还不是很清楚 大家帮忙分析以下,这样做有什么利弊呢?因为我接触不是很多; 另外,我一直是学生物的,是否计算机方面欠缺,以后学习会不会存在较大困难?(本人 不是那种知难而进的人,如果困难太大,我会受不了的) 还有,国内比较好的有关生物信息的有哪些地方好去,诚恳希望在行的人给我指导,成为 我的老师兼朋友 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : hehe,如果你是boss,这样当然很好啊 ─────────────────────────────────────── 作者 lynnet (小林), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日16:38:48 星期天) , 站内信件 ─────────────────────────────────────── 国内比较好的应该有北大的生物信息中心/中科院计算所等等 呵呵,我想应该还有一个很重要的问题。 作生物信息的人毕业以后一般都去哪,是不是都出国去了? 国内的公司要生物信息研究的人多么?好像看了半天,也都是学校在要人,而且要的人并 不多。纯生物信息的杂志也很少,搞科研会不会很困难啊? 如果出国,又一般什么样的地方? ─────────────────────────────────────── 作者 Feynman (KaKa), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日16:49:28 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── 对于生物背景的来说,进入这个领域最大的难度在于数学以及算法编程方面的欠缺, 考虑到查不多4年没有接触过这方面的知识了(硕士),补课会非常的辛苦,而且难度感 觉比学数学和计算机的补生物知识还要大,很多学生物的甚至连linux都不会用。。。 所以你考虑清楚了,难度肯定是有的,当然也要看你的知识背景和决心:) 姑妄言之 【 在 clastw () 的大作中提到: 】 : 还不是很清楚 : 大家帮忙分析以下,这样做有什么利弊呢?因为我接触不是很多; : 另外,我一直是学生物的,是否计算机方面欠缺,以后学习会不会存在较大困难?(本人 : 不是那种知难而进的人,如果困难太大,我会受不了的) : 还有,国内比较好的有关生物信息的有哪些地方好去,诚恳希望在行的人给我指导,成为 : 我的老师兼朋友 ─────────────────────────────────────── 作者 clastw (), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日16:50:45 星期天) , 站内信件 ─────────────────────────────────────── 好象是这样的,现在发展较慢 哎。。。逃不脱的命运啊 【 在 lynnet (小林) 的大作中提到: 】 : 国内比较好的应该有北大的生物信息中心/中科院计算所等等 : 呵呵,我想应该还有一个很重要的问题。 : 作生物信息的人毕业以后一般都去哪,是不是都出国去了? : 国内的公司要生物信息研究的人多么?好像看了半天,也都是学校在要人,而且要的人并 : 不多。纯生物信息的杂志也很少,搞科研会不会很困难啊? : 如果出国,又一般什么样的地方? ─────────────────────────────────────── 作者 clastw (), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日16:54:32 星期天) , 站内信件 ─────────────────────────────────────── 看来是困难重重啊,困难多还发展机会少;那是说,没多大意思了? 我倒是很相信自己的学习能力,不过我的确还不会LINUX 矛盾。。。 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : 对于生物背景的来说,进入这个领域最大的难度在于数学以及算法编程方面的欠缺, : 考虑到查不多4年没有接触过这方面的知识了(硕士),补课会非常的辛苦,而且难度感 : 觉比学数学和计算机的补生物知识还要大,很多学生物的甚至连linux都不会用。。。 : 所以你考虑清楚了,难度肯定是有的,当然也要看你的知识背景和决心:) : 姑妄言之 ─────────────────────────────────────── 作者 lynnet (小林), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日17:16:40 星期天) , 站内信件 ─────────────────────────────────────── Linux学起来很快的。只要你别把强求他也拥有windows的易用性和功能的多面性。 不过感觉就Linux现在这个样子,使用的方便性实在是不敢恭维,想到微软公司前阵子还 在抱怨说自己的系统使用还不够方便,Linux是没法和windows竞争客户的。真不知道国家 投在Linux上的钱都去那儿了。 【 在 clastw () 的大作中提到: 】 : 看来是困难重重啊,困难多还发展机会少;那是说,没多大意思了? : 我倒是很相信自己的学习能力,不过我的确还不会LINUX : 矛盾。。。 ─────────────────────────────────────── 作者 Feynman (KaKa), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日17:18:46 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── 呵呵,你用linux一定不多,否则不会这么说的 【 在 lynnet (小林) 的大作中提到: 】 : Linux学起来很快的。只要你别把强求他也拥有windows的易用性和功能的多面性。 : 不过感觉就Linux现在这个样子,使用的方便性实在是不敢恭维,想到微软公司前阵子还 : 在抱怨说自己的系统使用还不够方便,Linux是没法和windows竞争客户的。真不知道国家 : 投在Linux上的钱都去那儿了。 ─────────────────────────────────────── 作者 sunzx ([MECH01]zx|Ici je me tiens), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日17:22:47 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── 哈哈... "Unix IS user friendly... It's just selective about who its friends are." — Tollef Fog Heen 【 在 lynnet (小林) 的大作中提到: 】 : Linux学起来很快的。只要你别把强求他也拥有windows的易用性和功能的多面性。 : 不过感觉就Linux现在这个样子,使用的方便性实在是不敢恭维,想到微软公司前阵子还 : 在抱怨说自己的系统使用还不够方便,Linux是没法和windows竞争客户的。真不知道国家 : 投在Linux上的钱都去那儿了。 ─────────────────────────────────────── 作者 lazy (draughts), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日18:39:01 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── 方便性方面我觉得是这样的, linux下面的东东是用得越多才能体会到他的方便性, windows的东东是使得你第一眼看上去觉得比较方便. 不过对于大部分人来说计算机 都只是简单用用能满足要求就成, 所以从这个角度说linux的确易用性不好 【 在 lynnet (小林) 的大作中提到: 】 : Linux学起来很快的。只要你别把强求他也拥有windows的易用性和功能的多面性。 : 不过感觉就Linux现在这个样子,使用的方便性实在是不敢恭维,想到微软公司前阵子还 : 在抱怨说自己的系统使用还不够方便,Linux是没法和windows竞争客户的。真不知道国家 : 投在Linux上的钱都去那儿了。 ─────────────────────────────────────── 作者 lynnet (小林), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日18:56:57 星期天) , 站内信件 ─────────────────────────────────────── 我承认我用得不多,我学电脑一直都是用微软的系统,从dos到windows,为了做好单位的 网管,学了MCSE和MCDBA,一直担心有那么一天会收到微软的律师函,那可就得花一大笔 钱了。担心之余就期待逐步转向Linux,可现在的情况是我无法说服我的同事们转向Linu x。我知道Linux很便宜,据说安全性也好,但这要从很多方面去分析。 Linux要取代windows,一定是要争夺windows用户群,那你就必须满足windows用户的习惯 ,要不,就只有孤芳自赏了。可是Linux能做到windows那样的友好界面么。我举几个简单 的例子: 挂接usb盘,windows是会自动把u盘中的内容弹出来;Linux呢,你不能指望一个纯粹把电 脑当作工具的人每次都去敲打你的命令,也许有快捷的方法,但是我没办法在网络上搜索 到合适的脚本等等。 挂接原先windows的分区,能能不能做到自动挂接,而不是要我们去设置参数,要知道, 用惯了windows的人,是不愿意在没有GUI的界面和即时提示的状态下去设置的。 文本编辑,你们习惯上用什么,有什么好用的推荐一下? 参考文献的管理软件,比如EndNote,有没有Linux版的推荐一把? 什么时候驱动程序的安装能够做到更容易一些,我这个电脑是km400,费了好大劲才装上 显卡驱动,最好是不要用命令行的。 软件的安装能否提供一个类似windows的添加/删除程序功能,把所有软件的安装和卸载集 中管理,我觉得现在的rpm做得还不够友好。 redhat的当家人也认为Linux不适合普通用户,我觉得有道理。只希望中国投在Linux上的 钱能真正开花结果。我觉得中国有这么多人玩Linux,上面说的这些问题应该很容易解决 的。应该有人出面组织各种各样替代windows下常用软件的rpm包,集中在一起提供下载, 用惯了windows的人,比如像我的同事,在计算机应用方面都是傻瓜型的,希望他们自己 就能解决大部分的问题。 罗罗嗦嗦说了一大堆,很凌乱,敬请谅解。 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : 呵呵,你用linux一定不多,否则不会这么说的 ─────────────────────────────────────── 作者 lynnet (小林), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日19:02:00 星期天) , 站内信件 ─────────────────────────────────────── 此外还有一个看法,这个世界上用Linux的人也很多,大家都在开发修补这个系统,这么 多人的力量加起来应该不会比微软公司弱吧。如果有个良好的组织,对大家的工作进行合 理的分工,减少重复的劳动(我觉得这个应该会比微软的更容易,因为源代码是公开的) ,肯定能做出比windows更好的东西。对大多数人来说,需要的软件不会很多的,关键是 要有人来系统化地提供,比如提供应用软件的集成化,为普通用户提供一揽子方案,让用 户专注于如何应用这个系统完成自己的工作,而不是成天想着如何优化,如何安装。现在 有哪些组织在作这样的工作,我们应该支持这样的机构进行集成,而不是各自为战。你们 觉得呢? 【 在 lazy (draughts) 的大作中提到: 】 : windows的东东是使得你第一眼看上去觉得比较方便. 不过对于大部分人来说计算机 : 都只是简单用用能满足要求就成, 所以从这个角度说linux的确易用性不好 ─────────────────────────────────────── 作者 lazy (draughts), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日19:10:01 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── hehe, 还是我刚才说的, 开发linux的一方面多是资深的用户, 对于方便性不够的感受并 不明显, 而且相反举个例子来说, 如果你用了很久的vim或者emacs, 转过来让你去用 windows下面的编辑器会觉得非常非常不方便; 另一方面, 很多的linux开发者开发的目的 是为了自己用, 不像商业软件公司那样是为了卖钱. 再随便说说, 其实我觉得linux比起windows更容易是用户关注自己的应用工作, 至于你说 的很多人整天想着安装软件, 美化界面, 折腾中文等等纯粹是一种求全的心理, 东东我用 不用没关系, 但是没有就是不爽. 【 在 lynnet (小林) 的大作中提到: 】 : 此外还有一个看法,这个世界上用Linux的人也很多,大家都在开发修补这个系统,这么 : 多人的力量加起来应该不会比微软公司弱吧。如果有个良好的组织,对大家的工作进行合 : 理的分工,减少重复的劳动(我觉得这个应该会比微软的更容易,因为源代码是公开的) : ,肯定能做出比windows更好的东西。对大多数人来说,需要的软件不会很多的,关键是 : 要有人来系统化地提供,比如提供应用软件的集成化,为普通用户提供一揽子方案,让用 : 户专注于如何应用这个系统完成自己的工作,而不是成天想着如何优化,如何安装。现在 : 有哪些组织在作这样的工作,我们应该支持这样的机构进行集成,而不是各自为战。你们 : 觉得呢? ─────────────────────────────────────── 作者 lazy (draughts), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日19:20:09 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── 自动挂载usb也不是不可以做的, 自己研究一下autofs/automount就是了 编辑器当然是vim或者emacs 文献管理我还真不知道 硬件支持方面, 基本主流的都没问题, 常见的麻烦点的也就是迅驰的无线网卡和SIS的图 形芯片. 软件安装, 你说的哪个东东显然是有的. 然后还是直接命令行方便快捷, hehe 【 在 lynnet (小林) 的大作中提到: 】 : 我承认我用得不多,我学电脑一直都是用微软的系统,从dos到windows,为了做好单位的 : 网管,学了MCSE和MCDBA,一直担心有那么一天会收到微软的律师函,那可就得花一大笔 : 钱了。担心之余就期待逐步转向Linux,可现在的情况是我无法说服我的同事们转向Linu : x。我知道Linux很便宜,据说安全性也好,但这要从很多方面去分析。 : Linux要取代windows,一定是要争夺windows用户群,那你就必须满足windows用户的习惯 : ,要不,就只有孤芳自赏了。可是Linux能做到windows那样的友好界面么。我举几个简单 : 的例子: : 挂接usb盘,windows是会自动把u盘中的内容弹出来;Linux呢,你不能指望一个纯粹把电 : 脑当作工具的人每次都去敲打你的命令,也许有快捷的方法,但是我没办法在网络上搜索 : 到合适的脚本等等。 : ........................... ─────────────────────────────────────── 作者 chevalier (游侠◎为THU哭泣), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日20:33:49 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── .... 嗯 最好是不用自己作实验 但是又有人给你未发表的第一手实验数据 【 在 lylover (白愁飞(cinderella)) 的大作中提到: 】 : 显然是好事情,不过最好还是去做bioinfo的实验室。而且,如果不作实验,就坚决不要 : 作实验,要是以为一边作实验一边作计算是可能的,那... : 我是分子生物的研究生,每天实验枯燥不说,还接触很多毒性物质,想考博士去学习生物 : 信息这样,就可以不用做那些分子实验了,再说我对生物信息有些兴趣,怎样? ─────────────────────────────────────── 作者 chevalier (游侠◎为THU哭泣), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日20:41:47 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── 【 在 lynnet (小林) 的大作中提到: 】 : 标 题: Re: 帮忙看看我这样的想法 : 发信站: 北大未名站 (2004年05月09日18:56:57 星期天) , 站内信件 : : : 我承认我用得不多,我学电脑一直都是用微软的系统,从dos到windows,为了做好单位的 : 网管,学了MCSE和MCDBA,一直担心有那么一天会收到微软的律师函,那可就得花一大笔 : 钱了。担心之余就期待逐步转向Linux,可现在的情况是我无法说服我的同事们转向Linu : x。我知道Linux很便宜,据说安全性也好,但这要从很多方面去分析。 : : Linux要取代windows,一定是要争夺windows用户群,那你就必须满足windows用户的习惯 : ,要不,就只有孤芳自赏了。可是Linux能做到windows那样的友好界面么。我举几个简单 : 的例子: : : 挂接usb盘,windows是会自动把u盘中的内容弹出来;Linux呢,你不能指望一个纯粹把电 : 脑当作工具的人每次都去敲打你的命令,也许有快捷的方法,但是我没办法在网络上搜索 我不觉得敲命令比点鼠标麻烦 mount cp umount 挺快 比" 双击 双击 移动鼠标 右键 拷贝 回到**目录,粘贴 右键,禁用 拔出 " 强多了 : 到合适的脚本等等。 : : 挂接原先windows的分区,能能不能做到自动挂接,而不是要我们去设置参数,要知道, : 用惯了windows的人,是不愿意在没有GUI的界面和即时提示的状态下去设置的。 可以阿 据说Mandrake可以 自动搜fat分区自动mount : : 文本编辑,你们习惯上用什么,有什么好用的推荐一下? vim gvim emacs : 参考文献的管理软件,比如EndNote,有没有Linux版的推荐一把? 这个似乎没有endnote这么好上手的 : : 什么时候驱动程序的安装能够做到更容易一些,我这个电脑是km400,费了好大劲才装上 : 显卡驱动,最好是不要用命令行的。 出了说明你是新手外 不能再说明别的了 n多mm还不装windows的显卡驱动呢 : : 软件的安装能否提供一个类似windows的添加/删除程序功能,把所有软件的安装和卸载集 : 中管理,我觉得现在的rpm做得还不够友好 ..... rpm已经比添加删除程序强大了 dpkg就更不用说了 只是你不会用而已拉 : : redhat的当家人也认为Linux不适合普通用户,我觉得有道理。只希望中国投在Linux上的 : 钱能真正开花结果。我觉得中国有这么多人玩Linux,上面说的这些问题应该很容易解决 : 的。应该有人出面组织各种各样替代windows下常用软件的rpm包,集中在一起提供下载, 有n多这样的网页 上面列出window/linux软件对应关系表 你自己懒 不去找 那就没法子了 : 用惯了windows的人,比如像我的同事,在计算机应用方面都是傻瓜型的,希望他们自己 : 就能解决大部分的问题。 : : 罗罗嗦嗦说了一大堆,很凌乱,敬请谅解。 : : : 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : : 呵呵,你用linux一定不多,否则不会这么说的 : : : -- : : 走过来,走过去,没有人理我,孤独地落荒而逃 sigh ─────────────────────────────────────── 作者 chevalier (游侠◎为THU哭泣), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日20:46:06 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── 既然你觉得连redhat都还不够"友好"的话 推荐你先用mandrake吧 mandrake还不行 就magiclinux,一帮国人折腾的 汉化什么的应 该不需要你自己搞了 【 在 lynnet (小林) 的大作中提到: 】 : 此外还有一个看法,这个世界上用Linux的人也很多,大家都在开发修补这个系统,这么 : 多人的力量加起来应该不会比微软公司弱吧。如果有个良好的组织,对大家的工作进行合 : 理的分工,减少重复的劳动(我觉得这个应该会比微软的更容易,因为源代码是公开的) : ,肯定能做出比windows更好的东西。对大多数人来说,需要的软件不会很多的,关键是 : 要有人来系统化地提供,比如提供应用软件的集成化,为普通用户提供一揽子方案,让用 : 户专注于如何应用这个系统完成自己的工作,而不是成天想着如何优化,如何安装。现在 : 有哪些组织在作这样的工作,我们应该支持这样的机构进行集成,而不是各自为战。你们 : 觉得呢? ─────────────────────────────────────── 作者 lylover (白愁飞(cinderella)), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日20:59:39 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── 没事没事,linux几个月就可以上手(好像我学东西总是很慢)。好歹你还有个生物背景, 我连cell这样的课都没怎么听过...也照样做, 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : 对于生物背景的来说,进入这个领域最大的难度在于数学以及算法编程方面的欠缺, : 考虑到查不多4年没有接触过这方面的知识了(硕士),补课会非常的辛苦,而且难度感 : 觉比学数学和计算机的补生物知识还要大,很多学生物的甚至连linux都不会用。。。 : 所以你考虑清楚了,难度肯定是有的,当然也要看你的知识背景和决心:) : 姑妄言之 ─────────────────────────────────────── 作者 lylover (白愁飞(cinderella)), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日21:06:10 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── 错!我就算再落魄也不会这么无聊。注意,我说的是收集数据,没有指明是未发表的第一 手实验数据。 我很抱歉,如果使用未发表的数据作了计算发文章,我本人还是倾向于认为这是一篇实验 学的文章,bioinfo仅仅是陪衬一下。这样的东西,随手做做也就拉倒了,要是指望这个 ,呵呵,和作实验的同事争第一作者的准备要提前做好。 很多的bioinfo paper,也没听说用未发表的实验数据,照样很不错。 【 在 chevalier (游侠◎为THU哭泣) 的大作中提到: 】 .... 嗯 最好是不用自己作实验 但是又有人给你未发表的第一手实验数据 【 在 lylover (白愁飞(cinderella)) 的大作中提到: 】 : 显然是好事情,不过最好还是去做bioinfo的实验室。而且,如果不作实验,就坚决不要 : 作实验,要是以为一边作实验一边作计算是可能的,那... : 我是分子生物的研究生,每天实验枯燥不说,还接触很多毒性物质,想考博士去学习生物 : 信息这样,就可以不用做那些分子实验了,再说我对生物信息有些兴趣,怎样? ─────────────────────────────────────── 作者 dayhoff (愤怒的小马), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日21:36:52 星期天) , 站内信件 ─────────────────────────────────────── unix-like system is not designed for everyone 【 在 lynnet (小林) 的大作中提到: 】 : Linux学起来很快的。只要你别把强求他也拥有windows的易用性和功能的多面性。 : 不过感觉就Linux现在这个样子,使用的方便性实在是不敢恭维,想到微软公司前阵子还 : 在抱怨说自己的系统使用还不够方便,Linux是没法和windows竞争客户的。真不知道国家 : 投在Linux上的钱都去那儿了。 ─────────────────────────────────────── 作者 dayhoff (愤怒的小马), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日21:42:26 星期天) , 站内信件 ─────────────────────────────────────── try to learn some statistics and one easy language from now ...... 【 在 clastw () 的大作中提到: 】 : 我是分子生物的研究生,每天实验枯燥不说,还接触很多毒性物质,想考博士去学习生物 : 信息这样,就可以不用做那些分子实验了,再说我对生物信息有些兴趣,怎样? ─────────────────────────────────────── 作者 kingsyl (Healthy is first.), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日23:04:44 星期天), 站内信件 ─────────────────────────────────────── 文献管理? 我看见有人用perl脚本+NCBI pubmed ==>latex就可以搞定。 【 在 lazy (draughts) 的大作中提到: 】 : 自动挂载usb也不是不可以做的, 自己研究一下autofs/automount就是了 : 编辑器当然是vim或者emacs : 文献管理我还真不知道 : 硬件支持方面, 基本主流的都没问题, 常见的麻烦点的也就是迅驰的无线网卡和SIS的图 : 形芯片. : 软件安装, 你说的哪个东东显然是有的. 然后还是直接命令行方便快捷, hehe ─────────────────────────────────────── 作者 invoker (junkDNA), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月09日23:46:38 星期天), 转信 ─────────────────────────────────────── funny, people select friends, except those .... heihei, u know:) 【 在 sunzx ([MECH01]zx|Ici je me tiens) 的大作中提到: 】 : 哈哈... : "Unix IS user friendly... It's just selective about who its friends are." : — Tollef Fog Heen ─────────────────────────────────────── 作者 kokolu (时间的灰), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月10日00:11:51 星期一), 转信 ─────────────────────────────────────── 首先,偶从来不认为linux可以在common user的桌面应用上战胜windows ——至少在未来的二年内是这样 linux的优点是支持中高端的服务器 它目前的主要对手是solaris/freebsd,而不是windows 不过,你举的几个例子实在是…… 【 在 lynnet (小林) 的大作中提到: 】 : 标 题: Re: 帮忙看看我这样的想法 : 发信站: 北大未名站 (2004年05月09日18:56:57 星期天) , 站内信件 : : : 我承认我用得不多,我学电脑一直都是用微软的系统,从dos到windows,为了做好单位的 : 网管,学了MCSE和MCDBA,一直担心有那么一天会收到微软的律师函,那可就得花一大笔 : 钱了。担心之余就期待逐步转向Linux,可现在的情况是我无法说服我的同事们转向Linu : x。我知道Linux很便宜,据说安全性也好,但这要从很多方面去分析。 : Linux要取代windows,一定是要争夺windows用户群,那你就必须满足windows用户的习惯 : ,要不,就只有孤芳自赏了。可是Linux能做到windows那样的友好界面么。我举几个简单 : 的例子: : : 挂接usb盘,windows是会自动把u盘中的内容弹出来;Linux呢,你不能指望一个纯粹把电 : 脑当作工具的人每次都去敲打你的命令,也许有快捷的方法,但是我没办法在网络上搜索 : 到合适的脚本等等。 fstab + automount 2.4以上的kernel都可以轻松支持 而且,如果你用RH9(n长时间不用了,不是很sure)以后的桌面的话,应该可以 直接双击桌面图标 : : 挂接原先windows的分区,能能不能做到自动挂接,而不是要我们去设置参数,要知道, : 用惯了windows的人,是不愿意在没有GUI的界面和即时提示的状态下去设置的。 见上…… : : 文本编辑,你们习惯上用什么,有什么好用的推荐一下? 最好的当然是emacs(vi的扇子不要砍人……:Q) : 参考文献的管理软件,比如EndNote,有没有Linux版的推荐一把? bibtex (http://www.lecb.ncifcrf.gov/~toms/latex.html) : : 什么时候驱动程序的安装能够做到更容易一些,我这个电脑是km400,费了好大劲才装上 : 显卡驱动,最好是不要用命令行的。 这个这个……好象直接敲一个make install不比按鼠标困难吧? : : 软件的安装能否提供一个类似windows的添加/删除程序功能,把所有软件的安装和卸载集 : 中管理,我觉得现在的rpm做得还不够友好。 rpm不方便?那也别拿windows的add/remove这个垃圾功能说事吧…… 想要图形界面?GnoRPM/KPackage/Nautilus RPM 想要下载方便?apt-rpm 想要更高级的自动管理?gentoo's emerge : : redhat的当家人也认为Linux不适合普通用户,我觉得有道理。只希望中国投在Linux上的 : 钱能真正开花结果。我觉得中国有这么多人玩Linux,上面说的这些问题应该很容易解决 : 的。应该有人出面组织各种各样替代windows下常用软件的rpm包,集中在一起提供下载, : 用惯了windows的人,比如像我的同事,在计算机应用方面都是傻瓜型的,希望他们自己 : 就能解决大部分的问题。 RH中已经包括了绝大部分桌面用户常用的包 debian提供了n多预编译好了的软件包 gentoo可以让你自己在本地编译需要的包 : : 罗罗嗦嗦说了一大堆,很凌乱,敬请谅解。 最后,推荐二个网站: 情话王垠的: http://learn.tsinghua.edu.cn/homepage/2001315450/ The table of equivalents / replacements / analogs of Windows software in Linux http://linuxshop.ru/linuxbegin/win-lin-soft-en/index.shtml : : : 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : : 呵呵,你用linux一定不多,否则不会这么说的 : : : -- : : 走过来,走过去,没有人理我,孤独地落荒而逃 sigh ─────────────────────────────────────── 作者 Feynman (KaKa), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月10日00:26:15 星期一), 转信 ─────────────────────────────────────── 唉,本来是在谈论学习bioinfor过程中使用linux的问题,结果不知道怎么就转到win和 linux之争这个月经坑里面了,然后就好多人跟着跳了。。。 【 在 kokolu (时间的灰) 的大作中提到: 】 : 首先,偶从来不认为linux可以在common user的桌面应用上战胜windows : ——至少在未来的二年内是这样 : linux的优点是支持中高端的服务器 : 它目前的主要对手是solaris/freebsd,而不是windows : 不过,你举的几个例子实在是…… : fstab + automount : 2.4以上的kernel都可以轻松支持 : 而且,如果你用RH9(n长时间不用了,不是很sure)以后的桌面的话,应该可以 : 直接双击桌面图标 : 见上…… : ........................... ─────────────────────────────────────── 作者 cdragon (eaGle), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月10日09:12:06 星期一), 转信 ─────────────────────────────────────── 呵呵,这里面有一个"使用习惯"的问题 Win3.0 刚出来的时候, 也是倒彩声不断的 主要是你要经常用用 linux 【 在 lynnet (小林) 的大作中提到: 】 : Linux学起来很快的。只要你别把强求他也拥有windows的易用性和功能的多面性。 : 不过感觉就Linux现在这个样子,使用的方便性实在是不敢恭维,想到微软公司前阵子还 : 在抱怨说自己的系统使用还不够方便,Linux是没法和windows竞争客户的。真不知道国家 : 投在Linux上的钱都去那儿了。 ─────────────────────────────────────── 作者 cdragon (eaGle), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月10日09:16:23 星期一), 转信 ─────────────────────────────────────── 或者就用 Winlinux 呵呵 【 在 chevalier (游侠◎为THU哭泣) 的大作中提到: 】 : 既然你觉得连redhat都还不够"友好"的话 : 推荐你先用mandrake吧 mandrake还不行 就magiclinux,一帮国人折腾的 汉化什么的应 : 该不需要你自己搞了 ─────────────────────────────────────── 作者 cdragon (eaGle), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月10日09:18:17 星期一), 转信 ─────────────────────────────────────── 还有一堆根本没有生物试验数据的呢 (当然, 不包括 序列 啦) 【 在 lylover (白愁飞(cinderella)) 的大作中提到: 】 : 错!我就算再落魄也不会这么无聊。注意,我说的是收集数据,没有指明是未发表的第一 : 手实验数据。 : 我很抱歉,如果使用未发表的数据作了计算发文章,我本人还是倾向于认为这是一篇实验 : 学的文章,bioinfo仅仅是陪衬一下。这样的东西,随手做做也就拉倒了,要是指望这个 : ,呵呵,和作实验的同事争第一作者的准备要提前做好。 : 很多的bioinfo paper,也没听说用未发表的实验数据,照样很不错。 : .... : 嗯 最好是不用自己作实验 : 但是又有人给你未发表的第一手实验数据 ─────────────────────────────────────── 作者 cdragon (eaGle), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月10日09:19:21 星期一), 转信 ─────────────────────────────────────── 用 Perl 处理成 LaTeX 的文献库就可以了 【 在 kingsyl (Healthy is first.) 的大作中提到: 】 : 文献管理? : 我看见有人用perl脚本+NCBI pubmed ==>latex就可以搞定。 ─────────────────────────────────────── 作者 cdragon (eaGle), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月10日09:20:05 星期一), 转信 ─────────────────────────────────────── 同跳, 同跳 呵呵 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : 唉,本来是在谈论学习bioinfor过程中使用linux的问题,结果不知道怎么就转到win和 : linux之争这个月经坑里面了,然后就好多人跟着跳了。。。 ─────────────────────────────────────── 作者 Feynman (KaKa), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月10日15:08:32 星期一), 转信 ─────────────────────────────────────── 比如? 【 在 cdragon (eaGle) 的大作中提到: 】 : 还有一堆根本没有生物试验数据的呢 : (当然, 不包括 序列 啦) ─────────────────────────────────────── 作者 kokolu (时间的灰), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月10日17:13:50 星期一), 转信 ─────────────────────────────────────── 上面不是我re的 是别人用我id惹的 我才不会跳这样的坑,呵呵 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : 唉,本来是在谈论学习bioinfor过程中使用linux的问题,结果不知道怎么就转到win和 : linux之争这个月经坑里面了,然后就好多人跟着跳了。。。 ─────────────────────────────────────── 作者 cdragon (eaGle), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月11日09:03:52 星期二), 转信 ─────────────────────────────────────── 你可以去看看一些偏计算机算法的生物信息学会议 如,IEEE CSB 很多都是只有算法的,并不依赖于生物实验。 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : 比如? ─────────────────────────────────────── 作者 hitma (黄疯), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月11日10:07:49 星期二), 转信 ─────────────────────────────────────── : 有n多这样的网页 上面列出window/linux软件对应关系表 : 你自己懒 不去找 那就没法子了 http://www.linuxeden.com/edu/doctext.php?docid=3034 ^_^ ─────────────────────────────────────── 作者 Feynman (KaKa), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月11日11:13:37 星期二), 转信 ─────────────────────────────────────── faint,我当然知道有专门做算法,这个版也有一堆人是不做实验的 我是问你所谓的没有生物实验数据的数据是什么(不包括序列) 【 在 cdragon (eaGle) 的大作中提到: 】 : 你可以去看看一些偏计算机算法的生物信息学会议 : 如,IEEE CSB : 很多都是只有算法的,并不依赖于生物实验。 ─────────────────────────────────────── 作者 lylover (白愁飞(cinderella)), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月11日11:29:19 星期二), 转信 ─────────────────────────────────────── 切,这种常识性问题人家“不屑”回答你的,还是我给你启蒙一下。 比如,做进化计算,Nei的那篇PNAS,近期的看过么?你到哪里去找实验的数据?序列算 不算? 计算出来的ppi网络,没有完全被实验验证吧?(都验证了,大家就不用去做计算了) “生物实验数据”,这个概念本身就比较含糊,计算的算不算?我们做计算,呵呵,不也 是实验? 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 faint,我当然知道有专门做算法,这个版也有一堆人是不做实验的 我是问你所谓的没有生物实验数据的数据是什么(不包括序列) 【 在 cdragon (eaGle) 的大作中提到: 】 : 你可以去看看一些偏计算机算法的生物信息学会议 : 如,IEEE CSB : 很多都是只有算法的,并不依赖于生物实验。 ─────────────────────────────────────── 作者 Feynman (KaKa), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月11日11:32:49 星期二), 转信 ─────────────────────────────────────── 你个垃圾,说来说去还是就只有序列,我是想听听还有没有别的 【 在 lylover (白愁飞(cinderella)) 的大作中提到: 】 : 切,这种常识性问题人家“不屑”回答你的,还是我给你启蒙一下。 : 比如,做进化计算,Nei的那篇PNAS,近期的看过么?你到哪里去找实验的数据?序列算 : 不算? : 计算出来的ppi网络,没有完全被实验验证吧?(都验证了,大家就不用去做计算了) : “生物实验数据”,这个概念本身就比较含糊,计算的算不算?我们做计算,呵呵,不也 : 是实验? : faint,我当然知道有专门做算法,这个版也有一堆人是不做实验的 : 我是问你所谓的没有生物实验数据的数据是什么(不包括序列) ─────────────────────────────────────── 作者 microRNAs (Great MicroRNAs Database), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月11日11:51:28 星期二), 转信 ─────────────────────────────────────── 别的要自己做!呵呵 或者就是microarray的数据 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : 你个垃圾,说来说去还是就只有序列,我是想听听还有没有别的 ─────────────────────────────────────── 作者 lylover (白愁飞(cinderella)), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月11日11:59:58 星期二), 转信 ─────────────────────────────────────── 呵呵,也有很多数据不需要自己做的...当然,也没有条件做,比如ppi 【 在 microRNAs (Great MicroRNAs Database) 的大作中提到: 】 别的要自己做!呵呵 或者就是microarray的数据 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : 你个垃圾,说来说去还是就只有序列,我是想听听还有没有别的 ─────────────────────────────────────── 作者 cdragon (eaGle), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月11日17:58:25 星期二), 转信 ─────────────────────────────────────── ppi pathway or some ortholog list (such as InParanoid) 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : 你个垃圾,说来说去还是就只有序列,我是想听听还有没有别的 ─────────────────────────────────────── 作者 Feynman (KaKa), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月11日18:13:22 星期二), 转信 ─────────────────────────────────────── 这些都不算实验数据? 【 在 cdragon (eaGle) 的大作中提到: 】 : ppi pathway : or : some ortholog list (such as InParanoid) ─────────────────────────────────────── 作者 lylover (白愁飞(cinderella)), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月11日18:31:28 星期二), 转信 ─────────────────────────────────────── 你丫的有问题跑我这里问啊!小声点.... 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 这些都不算实验数据? 【 在 cdragon (eaGle) 的大作中提到: 】 : ppi pathway : or : some ortholog list (such as InParanoid) ─────────────────────────────────────── 作者 cdragon (eaGle), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月12日08:24:31 星期三), 转信 ─────────────────────────────────────── 部分 pathway 是预测的,没有经过试验验证的 那个 ortholog 就是裸算出来的 呵呵 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : 这些都不算实验数据? ─────────────────────────────────────── 作者 lylover (白愁飞(cinderella)), 信区: Bioinformatics 标题 Re: 帮忙看看我这样的想法 时间 北大未名站 (2004年05月12日10:36:09 星期三), 转信 ─────────────────────────────────────── ortholog不裸算怎么办?.... 我知道有实验验证,不过不多就是了。好在大家对这个的计算还是认同的。 【 在 cdragon (eaGle) 的大作中提到: 】 部分 pathway 是预测的,没有经过试验验证的 那个 ortholog 就是裸算出来的 呵呵 【 在 Feynman (KaKa) 的大作中提到: 】 : 这些都不算实验数据?
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