[合集]要查找一个酶全部序列，应该去哪个

发信人: kingsyl (Molecular Machine To Be Studied), 信区: Bioinformatics
标  题: [合集]要查找一个酶全部序列，应该去哪个
发信站: 北大未名站 (2004年03月21日19:54:42 星期天), 站内信件

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作者  Maat (知识·正义), 信区: Bioinformatics                                
标题  要查找一个酶的全部序列，应该去哪个数据库找                             
时间  北大未名站 (2004年01月08日18:29:56 星期四), 转信                       
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再做多序列比对
用什么程序做比较好
有这种数据库吗

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作者  kingsyl (做人要猴——欧道(《手机》妙语 )), 信区: Bioinformatics        
标题  Re: 要查找一个酶的全部序列，应该去哪个数据库找                         
时间  北大未名站 (2004年01月08日19:54:29 星期四), 站内信件                   
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一个酶只有一个序列

【 在 Maat (知识·正义) 的大作中提到: 】
: 再做多序列比对
: 用什么程序做比较好
: 有这种数据库吗

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作者  Maat (知识·正义), 信区: Bioinformatics                                
标题  Re: 要查找一个酶的全部序列，应该去哪个数据库找                         
时间  北大未名站 (2004年01月08日21:11:33 星期四), 转信                       
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不同物种里酶的序列是不一样的

【 在 kingsyl (做人要猴——欧道(《手机》妙语 )) 的大作中提到: 】
: 一个酶只有一个序列

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作者  kokolu (岁月如歌#蜕), 信区: Bioinformatics                             
标题  Re: 要查找一个酶的全部序列，应该去哪个数据库找                         
时间  北大未名站 (2004年01月08日21:25:18 星期四), 转信                       
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同一个物种里面同一种酶也可能不一样。比如有同工酶的情况

【 在 Maat (知识·正义) 的大作中提到: 】
: 不同物种里酶的序列是不一样的

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作者  ilovekoala (可怜考拉$郁闷生化$没有地方睡觉了，哭...), 信区: Bioinformatics
标题  Re: 要查找一个酶的全部序列，应该去哪个数据库找                         
时间  北大未名站 (2004年01月08日21:31:42 星期四), 转信                       
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呵呵
同一物种内氨基酸序列完全相同的酶也有可能序列不一样的
组织特异性
【 在 kokolu (岁月如歌#蜕) 的大作中提到: 】
: 同一个物种里面同一种酶也可能不一样。比如有同工酶的情况

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作者  kokolu (岁月如歌#蜕), 信区: Bioinformatics                             
标题  Re: 要查找一个酶的全部序列，应该去哪个数据库找                         
时间  北大未名站 (2004年01月08日22:10:30 星期四), 转信                       
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【 在 ilovekoala (可怜考拉$郁闷生化$没有地方睡觉了，哭...) 的大作中提到: 】
: 呵呵
: 同一物种内氨基酸序列完全相同的酶也有可能序列不一样的
                                          ~~~~~DNA序列？？
: 组织特异性

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作者  Maat (知识·正义), 信区: Bioinformatics                                
标题  Re: 要查找一个酶的全部序列，应该去哪个数据库找                         
时间  北大未名站 (2004年01月08日23:53:23 星期四), 转信                       
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啊
什么意思
从来没见过
大虾解释一下

【 在 ilovekoala (可怜考拉$郁闷生化$没有地方睡觉了，哭...) 的大作中提到: 】
: 呵呵
: 同一物种内氨基酸序列完全相同的酶也有可能序列不一样的
: 组织特异性

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作者  kingsyl (做人要猴——欧道(《手机》妙语 )), 信区: Bioinformatics        
标题  Re: 要查找一个酶的全部序列，应该去哪个数据库找                         
时间  北大未名站 (2004年01月09日00:08:32 星期五), 站内信件                   
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同工酶不一定是同一种酶吧

酶的数据库在cbi.pku.edu.cn中有
http://cn.expasy.org/cgi-bin/nicezyme.pl?1.1.1.1

enzyme

Noun 1. enzyme - any of several complex proteins that are produced by cells
and act as catalysts in specific biochemical reactions

酶enzyme
定义：一种能促进生化反应的蛋白质，通常能加快速反应速度。

【 在 kokolu (岁月如歌#蜕) 的大作中提到: 】
: 同一个物种里面同一种酶也可能不一样。比如有同工酶的情况

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作者  kokolu (岁月如歌#蜕), 信区: Bioinformatics                             
标题  Re: 要查找一个酶的全部序列，应该去哪个数据库找                         
时间  北大未名站 (2004年01月09日13:08:00 星期五), 转信                       
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【 在 kingsyl (做人要猴——欧道(《手机》妙语 )) 的大作中提到: 】
:  同工酶不一定是同一种酶吧
这确实值得考虑:)，需要进一步查证同工酶的定义

但是，同一种酶（具有同样的EC号），在不同物种里面的序列往往是有差异的

:  酶的数据库在cbi.pku.edu.cn中有
:  http://cn.expasy.org/cgi-bin/nicezyme.pl?1.1.1.1
: enzyme
: Noun 1. enzyme - any of several complex proteins that are produced by cells
: and act as catalysts in specific biochemical reactions
: 酶enzyme
: 定义：一种能促进生化反应的蛋白质，通常能加快速反应速度。