北京是国家的中央政府所在地，既可包含国家的立法部门驻地，也可以包含国家的行政部门驻地，针对性很强。而中国首都侧重于地理概念层次上的及地理关系的表达，是该问题形式化描述的观点，可作为地理描述的基础。他们之间的联系是：中国首都地理系统开发者通过组装北京的资料中可重用部分，可以避免从头开始建立地理知识库。中国首都与美国首都相比，中国首都的地理范围较广，但区内区县之间的关系较简单，主要用于科普层次的知识描述。

实际上，如果本体和知识库用同一语言表达的话，两者之间并没有清晰的界限。区别仅仅在于知识库的哪一部分是可以共享和重用的，哪一部分是针对特定应用的。这种区别往往还随着时间和具体的背景变化[2]。
[2] Mike Uschold. 1998. Knowledge level modelling: concepts and terminology. The Knowledge Engineering Review, Vol. 13:1, 1998, 5-29

或者，以前的知识库包含许多规则（rule），逻辑程序（logic programming）等表达力，是当前的本体研究所缺乏的。不过表达力一强，可判定性和推理复杂性就弱了。